製薬会社の年収ランキング2026年版｜業界平均854万円の実態と手取り目安

製薬会社の年収はどのくらい？まず業界平均の全体像から

製薬会社 年収は、国内の業種のなかでも高い水準にあるといわれます。有価証券報告書の「平均年間給与」を集計したanswers.and-pro.jpの調査では、直近の事業年度を公表した国内医薬品企業88社の平均は854.2万円で、前年度から25.5万円（3.1%）増加しました。プライム上場企業を中心に賃上げの影響が見られたとされています。

一方、国税庁の民間給与実態統計調査（令和7年分）によると、民間給与所得者全体の平均給与は487万円（男性597万円・女性342万円、正社員559万円・正社員以外210万円）です。集計方法も対象も異なるため単純比較はできませんが、製薬業界の平均が全体平均を大きく上回る傾向にあることは読み取れます。

ただし、これらはあくまで平均値です。研究・開発職、MR、管理部門などの職種、年齢、役職、雇用形態によって年収は大きく変わります。

2026年版・製薬会社 手取り目安">年収ランキングの上位企業

answers.and-pro.jpおよびedinetdb.jpの集計をもとに、上位10社をまとめると次のとおりです（有報の平均年間給与ベース、概算・目安）。

上位には従業員規模が小さいバイオベンチャーが入りやすく、平均値が大きく振れやすい点には注意が必要です。前年度比でも増減の幅が大きくなっています。

新薬大手6社の年収を比較すると1000万円台が中心

新薬大手では、中外製薬が1350.7万円（前年度比+143.4万円）で最も高く、武田薬品工業1144.5万円（+40.7万円）、アステラス製薬1131.5万円（+85.3万円）、エーザイ1123.3万円（+67.7万円）、第一三共1097.6万円（-16.6万円）、小野薬品工業1093.5万円（+76.2万円）と続きます。新薬大手上位6社のうち、前年度を下回ったのは第一三共のみでした。なお、小野薬品工業は2025年度から平均年収の算出方法を変更しており、基準外賃金（残業手当など）が含まれる点に留意してください。

有報の「平均年間給与」は実態とズレることがある

金融庁EDINETの有報から抽出したedinetdb.jpによると、医薬品セクター50社の分布は中央値648.4万円、P25が550.8万円、P75が758.3万円、P90が896.2万円でした。平均値だけを見ると、実際の従業員の多くよりも高く見える可能性があります。

理由としては、①有報の平均年間給与は提出会社（親会社）単体の数値で、連結子会社の従業員は含まれない、②従業員数の少ない企業は1人あたりの金額が振れやすい、③職種構成や平均年齢が企業ごとに異なる、といった点が挙げられます。ランキングを見るときは、平均年齢や従業員数、集計対象社数もあわせて確認するのがおすすめです。

年収1000万円台の手取り目安

平均年収から手取りを単純計算することはできませんが、nenshu-jp.comでは手取りの目安が次のように示されています（あくまで概算です）。

実際の手取りは、扶養家族の人数、住んでいる自治体、社会保険料の加入状況、各種控除の有無などで変わります。自分の条件に近い金額は手取り早見で確認してみてください。

製薬会社で年収を上げるには

一般的には、研究開発職やMRなどの専門性を高める、マネジメント職に進む、キャリアアップで大手・外資系企業へ移る、といった選択肢が挙げられます。ただし、平均年収は企業の規模や事業フェーズによって大きく変動するため、ランキングの数字だけで判断するのは避けたほうがよいでしょう。業界全体の水準感は年収指数、関連記事は記事一覧で確認できます。

まとめ

製薬会社の平均年収は、有報を集計した調査では業界全体で854.2万円（88社平均）と、民間給与所得者全体の平均487万円を大きく上回る水準にあります。ただし、上位はバイオベンチャーが占めており、平均値の振れ幅が大きいこと、有報の数値は提出会社単体であることに注意が必要です。自分の年収を考える際は、平均値だけでなく職種・年齢・雇用形態を踏まえた手取り目安まで確認しておきましょう。