薬剤師の平均年収はいくら？令和7年統計566.8万円の内訳と手取り目安

薬剤師の年収は487万円｜令和7年分 民間給与実態統計調査の男女・年齢別・手取り目安">平均年収は566.8万円（令和7年・賃金構造基本統計調査）

厚生労働省「賃金構造基本統計調査」令和7年（2025年）の一般労働者・産業計・企業規模計（10人以上）によると、薬剤師の推計年収は566.8万円でした。内訳は「きまって支給する現金給与額（月額）」39.87万円×12か月に、「年間賞与その他特別給与額」88.35万円を加えたものです。平均年齢は40.1歳、平均勤続年数は8.6年。この金額は所得税や社会保険料を差し引く前の額面で、統計上の平均値（中央値ではありません）である点に注意してください。

同調査の144職種を労働者数で加重平均した金額は545.5万円なので、薬剤師はそれを約21万円上回り、全職種平均の約1.04倍という水準です（totonoe.tech）。

調査年度によって「平均年収」が変わる理由

薬剤師の平均年収として599.3万円という数字を見たことがある人もいるかもしれません。これは2025年公開（2024年調査結果＝令和6年賃金構造基本統計調査）をもとに算出された金額で、令和7年調査の566.8万円とは差があります（pharma.mynavi.jp）。

差が生まれる主な理由は次のとおりです。

• 調査年が違う（年ごとに回答事業所や給与水準が変わる）
• 集計対象が違う（賃金構造基本統計調査はパートタイム労働者を含まない一般労働者のみ、企業規模10人以上）
• 平均値か中央値か、賞与の扱いをどうするかといった算出方法の違い

いずれの数字も「額面の平均値」であり、実際の年収は勤務先や地域、年齢で変動します。

男女別・勤務先別にみた薬剤師の年収

令和7年調査（一般労働者・産業計・企業規模計）の男女別では、男性605.7万円、女性539.4万円で、差は66.3万円でした。令和6年調査ベースでは男性651.1万円、女性555.8万円、調剤薬局勤務は583.8万円という集計もあります（pharma.mynavi.jp）。

企業規模別では、10〜99人規模の職場が586.75万円、1,000人以上の職場が564.9万円で、その差は約22万円です。規模による年収差は比較的小さく、どの規模の職場でも大きな違いは生じにくい傾向がうかがえます。

国税庁の統計と比べると高い水準

国税庁「民間給与実態統計調査」（令和7年分）によると、給与所得者全体の平均給与は487.0万円、男性597.0万円、女性342.0万円、正社員559.0万円、正社員以外210.0万円でした（nta.go.jp）。

薬剤師の566.8万円は、全体平均487.0万円を約80万円、正社員平均559.0万円を約8万円上回る計算になります。ただし民間給与実態統計調査はパート・アルバイトや役員を含む全給与所得者の平均で、調査の目的や集計範囲が異なるため、単純に比較できるものではありません。あくまで参考値として捉えてください。

薬剤師の手取りはいくら？年収566万円の場合の目安

額面から社会保険料と所得税・住民税を差し引いたものが手取りです。社会保険料は一般的に額面の14〜15%程度とされ、年収566.8万円なら約80〜85万円。所得税・住民税は各種控除や家族構成で変わりますが、扶養がいない場合でおおむね40〜50万円程度です。

そのため手取りは430〜445万円前後、月額にすると約36万円が目安になります。扶養家族がいる場合は税負担が軽くなって手取りが増えることがあり、住民税の金額は自治体によって異なります。より細かな金額は手取り早見で年収別の目安を確認してください。

年収を左右する要因

• 勤務先の種類：調剤薬局、ドラッグストア、病院、製薬企業などで水準が異なる
• 地域：都道府県によって給与水準に差がある
• 役職・資格：管理職や認定薬剤師などの資格が処遇に反映されることがある
• 雇用形態・勤務時間：パートタイムは上記統計に含まれないため、フルタイムと単純比較できない

一般的には、製薬企業や研究開発職では高めの年収になることがありますが、職種や雇用形態によって幅があります。

まとめ

薬剤師の平均年収は、厚生労働省「賃金構造基本統計調査」令和7年で566.8万円。国税庁の全給与所得者平均487.0万円を上回る水準です。ただし統計上の平均値であり、勤務先・地域・年齢によって変動しますし、手取りは430万円前後が目安です。自分の年収の位置を確かめたいときは年収指数を、関連する解説は記事一覧を参考にしてください。